用非监督维度作为embedding

这块就是在监督某些batch维度的情况下,同时加上30维非监督连续维度,把这些维度拿出来,当成PCA用,做下面的UMAP、聚类等。但效果比较差,去batch的时候经常就把细胞类型信息去没了,就算没有去掉细胞类型信息,画出来的umap也非常奇怪。

提到的数据集

hECA_lung数据

embedding_hECA_lung.html

HCC数据

embedding_LiverCancer.html